BCR/ABL transkrypt p190, p210/230 – jakościowo

Opis badania

BCR::ABL1 transkrypt p190, p210/230 – jakościowo

Badanie wykonuje się w celu identyfikacji onkogenu BCR::ABL1 i rozpoznania bądź wykluczenia przewlekłej białaczki szpikowej (CML) u pacjenta. Badanie przeprowadza się także w ostrych białaczkach, w których identyfikacja onkogenu BCR::ABL1 jest konieczna do modyfikacji postępowania terapeutycznego.

Onkogen BCR::ABL1 jest kinazą tyrozynową, której aktywność wzmaga proliferację komórek hematopoetycznych. Powstaje on na drodze translokacji wzajemnej t(9;22)(q34;q11) w efekcie fuzji genów BCR oraz ABL1.

Wskazania do badania

Ekspresja onkogenu BCR::ABL1 jest cechą patognomoniczną przewlekłej białaczki szpikowej (100% przypadków) i niewielkiego odsetka ostrych białaczek limfoblastycznych (ok. 20%) i szpikowych (poniżej 3%).

Z uwagi na liczne skuteczne, celowane opcje terapeutyczne wykrycie transkryptu BCR::ABL1 jest niezbędnym elementem diagnostyki nowotworów mieloproliferacyjnych i ostrych białaczek. Zastosowanie metody molekularnej dostarcza, poza samym wynikiem jakościowym, informacje dotyczące możliwości przyszłego monitorowania efektywności leczenia i poziomu mierzalnej choroby resztkowej u pacjenta.

Zakres badania

Badanie obejmuje detekcję transkryptu BCR::ABL1 i wykonywane jest z krwi obwodowej lub szpiku kostnego. Gwarantowany zakres badania obejmuje co najmniej typowe warianty transkryptu BCR-ABL1: P210 (e13a2 i e14a2), P190 (e1a2) oraz P230 (e19a2), jednak możliwa jest też detekcja nietypowych, bardzo rzadkich odmian BCR::ABL1: e13a3, e14a3, e1a3, e18a2, e20a2, e18a3, e19a3, e20a3 e6a2, e8a2,e6a3, e8a3.

Wynik prezentowany jest w formie jakościowej, w przypadku wyników dodatnich podawana jest informacja o rodzaju transkryptu fuzyjnego (P190/P210/P230/transkrypt wariantowy) oraz informacja o możliwości późniejszego monitorowania molekularnego metodą ilościową RQ-PCR.

Czas realizacji to maksymalnie 12 dni roboczych.

Stosowana metoda

W badaniu stosujemy metodę tandemowego multiplex-qPCR, która pozwala ocenić pełen zakres transkryptów fuzyjnych BCR::ABL1. Daje ona gwarancję wykrycia wszystkich typowych (P190, P210, P230) i większości nietypowych form onkogenu. Metoda umożliwia także określenie, czy jest możliwe dalsze monitorowanie leczenia pacjenta metodą ilościową.

Badany materiał

Badanie wykonywane jest z krwi lub szpiku kostnego.

Przed pobraniem

Badanie nie wymaga wcześniejszego przygotowania – pacjent nie musi być na czczo, a pobranie może zostać wykonane o dowolnej porze.

Zastosowanie

Badanie molekularne PCR na obecność genu BCR::ABL znajduje się w wśród wymaganych badań diagnostycznych, aby zakwalifikować chorego na przewlekłą białaczkę szpikową (ICD-10: C92.1) do leczenia w ramach programu lekowego – załącznik B.14.

Przy kwalifikacji do leczeniu chorych na ostrą białaczkę limfoblastyczną (ICD-10: C91.0) substancjami czynnymi: ponatynibem, blinatumomabem od 2. lub kolejnej linii leczenia lub terapii inotuzumabem ozogamycyny od 2. lub kolejnej linii leczenia wymagane jest badanie molekularne PCR metodą jakościową lub ilościową na obecność genu BCR-ABL we krwi lub szpiku – załącznik B.65.

Badania powinny być wykonywane wyłącznie w laboratoriach, które uzyskały certyfikat standaryzacji oznaczania genu BCR::ABL wydawany przez PALG (Polish Adult Leukemia Group) lub Polskie Towarzystwo Genetyki Człowieka. W Oncogene posiadamy stosowny certyfikat wydany przez Sekcję Hematologii Molekularnej PTGC.

Komplementarne badania

Metodę można zastosować wyłącznie w celu wykrycia BCR-ABL1 przed rozpoczęciem leczenia. Do oceny terapii i określenia stanu MRD zalecamy wykorzystanie metody ilościowej RQ-PCR, stosownej dla stwierdzonego u pacjenta uprzednio transkryptu. W celu oceny typu oporności na inhibitory kinaz tyrozynowych stosowana jest metoda sekwencjonowania domeny kinazowej (KD BCR::ABL1). Uzupełnieniem diagnostyki metodą molekularną jest badanie FISH rearanżacji t(9;22)(q34;q11)

KD BCR-ABL1 – mutacje oporności w domenie kinazowej BCR-ABL1 met. NGS – sprawdź tutaj

Źródła – literatura naukowa

• Tong YQ i wsp . New rapid method to detect BCR-ABL fusion genes with multiplex RT-qPCR in one-tube at a time. Leuk Res. 2018 Jun;69:47-53. [dostęp]
• Gabert et al. Standardization and quality control studies of ‘real-time’ quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction of fusion gene transcripts for residual disease detection in leukemia – A Europe Against Cancer Program. Leukemia 2003 [dostęp]